DMTU 0.350 x64にて、「全更新」が最初の自動対象フォルダのみで終了してしまいます。
なお、「全テスト」ではすべての自動対象フォルダが実行されます。
ですので、バックアップできていないことに今日まで気づきませんでした。これは非常にまずい気がします……。
また、DMTU 0.342 x64に戻すと正常に動作します。
ご確認いただければ幸いです。

ご連絡ありがとうございます。
ご不便をおかけし申し訳ありません。

私の方でも確認したところ、ご指摘の現象の原因がわかりました。

バックアップ中に何らかのエラーが発生した場合に、発生したフォルダ設定の次のバックアップが実行されないことが原因でした。
（エラーを無視する場合も上記が再現しました）

更新ファイルがなかったり、エラーにならない場合は想定通りの動作になりました。
バグのため、修正しますのでお待ちください。

バグを修正した Ver.0.351 を公開しました。
確認をお願いします。

まだ不具合があればご連絡ください。

早速、ver.0.351で全更新を実行したところ、正常に動作いたしました。
迅速に対応していただき、どうも有難うございました。