元々の仕様とは判っているのですが、デフォルトのフォルダの設定情報はレジストリ保存になっているのですが、これを外した状態のものを作れないでしょうか？　OSを再インストールする度にうっかりiniファイルを駄目にする事が結構あるのです。コマンドラインスイッチで、強制的にiniファイル読み込みとかでもOKです。ご検討下さいます様お願い申し上げます。

なるほど、フォルダ設定をレジストリに保存しないバージョンですね。
たしかに私自身もレジストリは使わないので作っても良いかなと思います。

逆に、レジストリを使う設定で使っている人っているのでしょうか…？
もしいないなら次回のバージョンはレジストリに保存しないバージョンにしてしまおうかなと思います。
（いつリリースできるかわかりませんが(^^;）

ちなみに、元々 INI ファイル名を指定して実行するコマンドラインオプションがあります。
/ini=ファイル名
を実行時に付けると、INI ファイルが使用されるようです。

ただ、初めてインストールされたときにうまく動くかどうかは試してみないとわかりません。