元々の仕様とは判っているのですが、デフォルトのフォルダの設定情報はレジストリ保存になっているのですが、これを外した状態のものを作れないでしょうか？　OSを再インストールする度にうっかりiniファイルを駄目にする事が結構あるのです。コマンドラインスイッチで、強制的にiniファイル読み込みとかでもOKです。ご検討下さいます様お願い申し上げます。

Ver.0.33 以降のバージョンは INI ファイルへの保存がデフォルトになっています。
お試しください。