win7 でusersフォルダを丸ごとバックアップしたいのですが、ミラーリングをしようとすると、Application Data　フォルダが何階層も無限に作成されてしまいます。
おそらくショートカットがループしている事が原因と思われますが、解決策は無いでしょうか。

各ユーザごとの「Application Data」は「\Users\ユーザ名\AppData\Roaming」フォルダに
リンクしていてループは発生しないため、
「All Users\Application Data」のみ無視すれば良いかと思います。

ジャンクションを無視するオプションについては、検討します。