このソフトには、非常にお世話になっています。
質問ですが、コピー元にシンボリックリンクが作成されていると、コピー先で
エラーになりますが、ターゲット指定でシンボリックリンクを除外する設定
というのは、ありますでしょうか？

Ver.0.370 でシンボリックリンクの無視機能を追加しました。
お試しください。